燕郊高新区管委会机关党委的机构设置由综合办公室和十六个部门党支部组成。

    十六个党支部分别为：

　　1.党政办公室党支部

　　2.投资促进局党支部

　　3.经济发展局党支部

　　4.住房和规划建设局党支部

　　5.人力资源和社会保障局党支部

　　6.财政局党支部

　　7.社会发展局党支部

　　8.国土资源局党支部

　　9.园林绿化局党支部

　　10.城市管理综合执法局党支部

　　11.市政管理局党支部

　　12.安全生产监察大队党支部

　　13.创业中心党支部

　　14.纪工委党支部

　　15.工会党支部

　　16.机关老干部党支部